CBI学会2020年大会の企業セッションES-13での発表で使用したスライドを公開します。
AWSのParallel Clusterでクラウド上にPCクラスターを構築し、そこでスクリーニング 計算を実行した際の計算時間やコスト等について紹介。
スクリーニング 計算のプログラムにはmyPrestoのscreening_packを、化合物ライブラリにはLigandBOXを用いた。
複数のインスタンスタイプを使って、それぞれスクリーニング 計算を試したところ、ARMベースCPUでAWSが設計したAWS Graviton 2を搭載したインスタンスのコストパフォーマンスが良かった。