新着情報
GROMCS2021の動作検証
2021/1/28にリリースされたGROMACS 2021のインストールと動作検証を、クラウドの計算機を使って実行しました。 比較的小さい系ですが、仮想48CPUコアの計算機で、1nsのMD計算を10 …
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AWSとmyPrestoでのインシリコスクリーニング 資料
CBI学会2020年大会の企業セッションES-13での発表で使用したスライドを公開します。 AWSのParallel Clusterでクラウド上にPCクラスターを構築し、そこでスクリーニング 計算を実 …
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myPrestoPortalのLinuxでの動作状況
AWSで、CentOS7/8、Ubuntu18/20、AmazonLinux2のデスクトップ環境をそれぞれ作成し、myPrestoPortalの動作検証を行いました。 (2020/9/29) 動作検証 …
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Amazon Linux2 AMIを使った分子研究用環境構築手順
(2021.6.19 修正) 修正前: conda install -c rdkit rdkit 修正後: conda install -c conda-forge rdkit (手順変更に関する詳し …
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分子研究用Python環境の設定
このページでは、AWSで借りたCentOS7のクラウドサーバーにおいて、RDkit、NGLview、PyMOLを、Jupyter Notebookから使える環境設定方法について紹介します。バージョンが …
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分子シミュレーション環境設定
Amazon Web Service (AWS)で借りたクラウドサーバーに、分子シミュレーション関係のプログラムをインストールして、リモートデスクトップ接続で利用可能な環境を構築してみました。このペー …
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Ubuntu18にリモートデスクトップ接続する手順
Ubuntu18.04LTSのクラウドサーバーに、リモートデスクトップ接続する手順の紹介。 今回は、AWSで借りたクラウドサーバーにGNOMEとtigervncをインストールした。 (2020/4/3 …
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ぶら下げスタンド試作中
物をぶら下げるスタンドを、3Dプリンターを使って試作しています。 今回は、流しの横に設置して、濡れた物をぶら下げることを想定しています。 中央と左のものは、2つのパーツで印刷して合体させたもの、右のも …
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新型コロナウィルス・メインプロテアーゼ分子模型販売中
次のサイトで、新型コロナウィルス・メインプロテアーゼ分子模型を販売中です。 https://biomodeling.theshop.jp
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