myPrestoのcosgeneでのMDの実行例です。
周期境界条件で、タンパク質と低分子化合物との複合体のMD計算実行の例です。
cosgene_pack180227のテスト計算(bin/test_MD_4lxz_peri_cosgene_MPI_4.sh)を実行したものです。myPresto Portalで読み込んで、同じトラジェクトリを描画方法を変えてアニメーションを作成し、MacOSXのプレビューで連結しました。
実行環境：
CentOS 6.8
参考：
myprestoでのmd計算例